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a) Administración Central de Operación Aduanera.
b) Administración Central de Normatividad Aduanera.
c) Administración Central de Investigación Aduanera.
d) Administración Central de Asuntos Aduaneros Internacionales.
e) Administración Central de Planeación y Coordinación Estratégica Aduanera.
f) Administración Central de Equipamiento e Infraestructura Aduanera.
 
Aduanas:
 
  1. Aduana de Aguascalientes, con sede en Aguascalientes.
  2. Aduana de Ensenada, con sede en Baja California.
  3. Aduana de Mexicali, con sede en Baja California.
  4. Aduana de Tecate, con sede en Baja California.
  5. Aduana de Tijuana, con sede en Baja California.
  6. Aduana de La Paz, con sede en Baja California Sur.
  7. Aduana de Ciudad del Carmen, con sede en Campeche.
  8. Aduana de Ciudad Acuña, con sede en Coahuila de Zaragoza.
  9. Aduana de Piedras Negras, con sede en Coahuila de Zaragoza.
  10. Aduana de Torreón, con sede en Coahuila de Zaragoza.
  11. Aduana de Manzanillo, con sede en Colima.
  12. Aduana de Ciudad Hidalgo, con sede en Chiapas.
  13. Aduana de Ciudad Juárez, con sede en Chihuahua.
  14. Aduana de Chihuahua, con sede en Chihuahua.
  15. Aduana de Ojinaga, con sede en Chihuahua.
  16. Aduana de Puerto Palomas, con sede en Chihuahua.
  17. Aduana del Aeropuerto Internacional de la Ciudad de México, con sede en el Distrito Federal.
  18. Aduana de México, con sede en el Distrito Federal.
  19. Aduana de Acapulco, con sede en Guerrero.
  20. Aduana de Guadalajara, con sede en Jalisco.
  21. Aduana de Toluca, con sede en el Estado de México.
  22. Aduana de Lázaro Cárdenas, con sede en Michoacán.
  23. Aduana de Colombia, con sede en Nuevo León.
  24. Aduana de Monterrey, con sede en Nuevo León.
  25. Aduana de Salina Cruz, con sede en Oaxaca.
  26. Aduana de Puebla, con sede en Puebla.
  27. Aduana de Guanajuato, con sede en Guanajuato.
  28. Aduana de Querétaro, con sede en Querétaro.
  29. Aduana de Cancún, con sede en Quintana Roo.
  30. Aduana de Subteniente López, con sede en Quintana Roo.
  31. Aduana de Mazatlán, con sede en Sinaloa.
  32. Aduana de Agua Prieta, con sede en Sonora.
  33. Aduana de Guaymas, con sede en Sonora.
  34. Aduana de Naco, con sede en Sonora.
  35. Aduana de Nogales, con sede en Sonora.
  36. Aduana de San Luis Río Colorado, con sede en Sonora.
  37. Aduana de Sonoyta, con sede en Sonora.
  38. Aduana de Dos Bocas, con sede en Tabasco.
  39. Aduana de Altamira, con sede en Tamaulipas.
  40. Aduana de Ciudad Camargo, con sede en Tamaulipas.
  41. Aduana de Ciudad Miguel Alemán, con sede en Tamaulipas.
  42. Aduana de Ciudad Reynosa, con sede en Tamaulipas.
  43. Aduana de Matamoros, con sede en Tamaulipas.
  44. Aduana de Nuevo Laredo, con sede en Tamaulipas.
  45. Aduana de Tampico, con sede en Tamaulipas.
  46. Aduana de Tuxpan, con sede en Veracruz.
  47. Aduana de Veracruz, con sede en Veracruz.
  48. Aduana de Coatzacoalcos, con sede en Veracruz.
  49. Aduana de Progreso, con sede en Yucatán.
 
Las unidades administrativas​ citadas en las fracciones que anteceden, podrán ubicarse en cualquier municipio que corresponda a la entidad federativa que identifique la Aduana, así como en el Aeropuerto Internacional o en el puerto que corresponda a esa entidad federativa. Tratándose del Distrito Federal, las aduanas podrán estar ubicadas en éste o en cualquiera de los municipios que forman su área conurbada. El Jefe del Servicio de Administración Tributaria podrá establecer o suprimir las secciones aduaneras correspondientes.
 
Fundamento legal: Reglamento Interior del Servicio de Administración Tributaria, publicado en el DOF el 22 de octubre de 2007, y sus modificaciones publicados en el DOF el 29 de abril de 2010 y 13 de julio de 2012.